藤岡財閥のご令嬢、藤岡アイリは藤岡工業が開発した強化スーツを装着し人知れず正義のヒロインメタルウーマンとしてオーガスシティーの平和のために日夜戦っていた。そんなある日、誘拐された市長を救出するため、ガイスターと名乗る謎のテロリストと戦う事に。死闘の末、市長を救出するメタルウーマン。しかし、犯罪者一味は逃亡をはかり、黒幕の正体を掴み損ねてしまう。しかも、ガイスターはメタルウーマンの強化スーツのシールドを、破壊するほどの強力な兵器で武装していたのだ。犯罪者の裏に強大な黒幕の存在を予感するメタルウーマン…。その頃、オーガスシティーの征服を目論む村井議員は、ガイスターと結託してメタルウーマンを抹殺しようと画策していた。果たして、メタルウーマンは恐るべき陰謀を阻止する事ができるのか！